Илко Пиргов e юноша на OФК Пирин (Гоце Делчев). В професионалния футбол дебютира отново там през 2002-ра година, когато е едва на 16. Интересен факт е, че първият му съперник в мач от елита е именно отбора на ПФК Локомотив (Пловдив). През 2004-та година преминава в ПФК ЦСКА (София) и остава при столичани три поредни сезона.
След 6 месечен престой в Румъния (в КС Отопени) се завръща в родната лига, присъединявайки се към редиците на ПФК Черно море (Варна). В началото на 2012-та година става част от ФК Литекс (Ловеч), който е и тогавашният действащ шампион на България. Следват кратки периоди в ПФК Черно море (Варна) и ПФК Берое (Стара Загора).
От лятото на 2016-та година защитава цветовете на ПФК Локомотив Пловдив и има голям принос за спечелването на Купа на България 2018/19.
Донася трофея за втора поредна година на „Лаута“ през следващия сезон (2019/20). По време на дузпите на финалния мач срещу ПФК ЦСКА-София (5:3) застава на вратата на „черно-белите“ и успешно спасява удара на Али Соу. Успешният сезон продължава и със спечелването на Суперкупата на България срещу Лудогорец през август 2020-та.