Кенан Муслимович е преминал през юношеските формации на ФК Аустрия (Виена), ФК Адмира (Мьодлих) и ФК Новара (Берети). Професионален футбол заиграва с ФК Младост (Какани) през сезон 2015/16. Играл е за сръбския ФК Нови Пазар и немските ФК Кайзерслаутерн II, ФК Регенсбург II и ФК Пипинсриед.

От февруари 2020-та година е част от представителния отбор на ПФК Локомотив (Пловдив). Печели Купа и Суперкупа на България с “черно-белите” през сезон 2019/20.